游戏王：怪兽之决斗 第 1 季 凶恶‧重机械卡组

海马濑人抢得了武藤游戏的爷爷武藤双六所持有的罕贵卡“青眼白龙”，并将其撕烂。游戏向海马发起决斗。面对海马所拥有的三只青眼白龙、游戏被逼得走投无路，最终凭借着五张意义不明的卡召唤出最强的艾克佐迪亚。 决斗：武藤游戏VS海马濑人

游戏收到了一个录像带，这是决斗怪兽之父贝卡斯·J·克罗佛多所寄来的。当游戏打开录像带观看时，一场游戏和贝卡斯之间的黑暗游戏开始了！ 决斗：武藤游戏VS贝卡斯

为了救出爷爷，游戏和他的朋友们接受了贝卡斯的决斗王国大赛的邀请，乘坐着豪华游轮前往贝卡斯的举办大赛的小岛。在船上，游戏遇到了假意接近他们的日本冠军昆虫羽蛾。羽蛾的目的便是把对他有威胁的游戏所持有的最强卡——艾克佐迪亚处理掉！

终于到达了决斗王国小岛，第一场决斗游戏向全日冠军羽蛾发起了挑战！羽蛾熟练了运用场地的规则，操控着昆虫大军向游戏步步逼近。决斗：武藤游戏VS昆虫羽蛾

游戏使用陷阱卡“神圣防护罩-反射镜力- ”把羽蛾的昆虫大军全灭了，羽蛾宣传将要召唤出最强的怪兽——究极完全态大飞蛾。虽然游戏阻止了最终形态的的孵化，不过大飞蛾还是出现了。 决斗：武藤游戏VS昆虫羽蛾

游戏的好朋友城之内克也也开始了第一场决斗，他的对方是女性决斗者孔雀舞。孔雀舞操控着神鹰女郎向城之内袭来。城之内获胜的希望寄托在游戏赠予的“时间魔术师”上。 决斗：城之内VS孔雀舞

武藤游戏的第二场决斗开始了，其对方是擅长利用海洋场地的梶木渔太。渔太操作的海产怪兽们在水中使得游戏的怪兽无法攻击，让游戏陷入苦战。决斗：武藤游戏VS梶木渔太

海马濑人的弟弟海马圭平向游戏发起挑战。同时，贝卡斯的手下向海马逼近······

贝卡斯的刺客物腹语师(ものまねし)扮成海马濑人的模样、使用盗取的海马的卡组向游戏发起挑战。面对强大的青眼白龙，游戏只能坚固防守。决斗：武藤游戏VS死者的腹语师

游戏使用魔术礼帽来防御和陷阱卡弱化青眼白龙的组合，总算击倒了第一只青眼白龙，也因为海马的入侵贝卡斯的电脑使得第二只青眼白龙也消失，然后对方亮出了第三只青眼白龙。游戏使用死者苏生使之前被打倒的青眼白龙复活，让青眼白龙对抗青眼白龙。

孔雀舞派遣硬汉龙崎去挑战城之内克也。面对龙崎的强大的龙族怪兽，城之内克也使用野蛮人1号和野蛮人2号开始反击。

龙崎得知城之内曾击败过孔雀舞，赌下自己的稀有卡“真红眼黑龙”和诚之内的“时间魔术师”。

本田、杏子、城之内和游戏的灵魂被暗貘良封印在各自喜欢的卡片。为了夺回大家的灵魂，暗游戏和暗貘良的决斗开始了。 决斗：暗游戏VS暗貘良

夜间，幻影企业派来的狩猎决斗者打败了孔雀舞并夺取她的所有星星了。然后杀手挑战武藤游戏。决斗：武藤游戏VS黑暗决斗杀手

游戏使出“光之护封剑”把对方藏在暗处的怪兽全部暴露。 决斗：武藤游戏VS黑暗决斗杀手

消失的海马归来了，带着新开发的决斗盘前往决斗王国岛挑战贝卡斯，到达时遇到了游戏等人。决斗：海马濑人VS城之内克也

城之内被基斯等人拐到了某个洞穴里的墓场场地进行决斗。没有游戏等人帮助下，城之内开始决斗。 决斗：城之内克也VS鬼骨冢

面对骨冢的不死身的僵尸怪兽，即使时间魔术师、真红眼黑龙也被打倒。决斗：城之内克也VS鬼骨冢

洞穴的出口被基斯等人封住了。游戏等人寻找着其他出口，这时遇到了迷宫兄弟。决斗：武藤游戏&城之内克也VS迷宫兄弟

迷宫兄弟使用“迷宫的变化”使得城之内和游戏的怪兽被分开。迷宫兄弟瞄准了城之内！决斗：武藤游戏&城之内克也VS迷宫兄弟

迷宫兄弟召唤出最强的怪兽风、雷、水魔神。决斗：武藤游戏&城之内克也VS迷宫兄弟

离开迷宫的游戏等人开到了贝卡斯的城堡前方。这时海马濑人阻挡在他们歼面前。　　决斗：武藤游戏VS海马濑人

海马使用破坏卡组的战术，把游戏卡组中的强力怪兽全部破坏掉。另外，海马把3只青眼白龙融合，召唤出攻击力高达4500的青眼究极龙。决斗：武藤游戏VS海马濑人

游戏使用“栗子球”和“增殖”的战术封锁了海马的青眼究极龙的攻击，使用“猛犸的墓场”弱化青眼究极龙。眼看要被反败为胜，海马开始了轻生的举动。　　决斗：武藤游戏VS海马濑人

游戏败给了海马，星星全被取走了。这时孔雀舞出现在他们面前。　　决斗：真崎杏子VS孔雀舞

打败游戏的海马进入贝卡斯的城堡，使用新开发的决斗盘挑战贝卡斯，贝卡斯却要木马代替他决斗。　　决斗：海马濑人VS贝卡斯

拥有千年眼力量的贝卡斯能够读取海马心中所想，并夺取了海马的一只青眼白龙。这时贝卡斯打出了“卡通世界”。　　　　　　决斗：海马濑人VS贝卡斯

决战前夜，为了爷爷双六和海马兄弟，游戏发誓要打倒贝卡斯。本田为了探寻贝卡斯的秘密而在城中探索。夜间，城之内的参加决赛的卡被基斯被偷走了。

决胜淘汰赛开始了，第一战是游戏对战孔雀舞。面对孔雀舞的战术，游戏似乎走投无路。 决斗：武藤游戏VS孔雀舞

游戏终于破解了孔雀舞的战术，但面对孔雀舞场上的强力怪兽，只有召唤出混沌战士才能逆转。　　决斗：武藤游戏VS孔雀舞

城之内和基斯的决斗火热的进行着，贝卡斯洞察着二人代表着希望和绝望的两颗心。决斗：城之内VS基斯·霍华德

淘汰赛决赛。

淘汰赛决赛。

游戏终于迎来和贝卡斯决战的时刻，只要赢了贝卡斯，爷爷双六和海马兄弟的灵魂就会得到解放。本田不太相信贝卡斯会守诺言，决斗一个人去寻找海马兄弟。决斗：武藤游戏VS贝卡斯

游戏的策略全被贝卡斯识破，这时贝卡斯终于使出了“卡通世界”进一步打击游戏。本田在营救海马兄弟时遇到了阻拦，这时来帮助本田的是暗貘良。 决斗：武藤游戏VS贝卡斯

两个游戏不断地使出心灵交替破解贝卡斯的用千年眼洞察人心的战术。决斗：武藤游戏VS贝卡斯

破解了贝卡斯的卡通世界后，贝卡斯开启了“黑暗游戏”模式，意图以此磨损另一个游戏的体力。决斗：武藤游戏VS贝卡斯

游戏终于倒下了，只剩下暗游戏一人奋战。这时，杏子、本田、城之内然后游戏……4人的友情的纽带对抗黑暗的力量！ 决斗：武藤游戏VS贝卡斯

败北后的贝卡斯在房间里遇到了暗貘良。暗貘良的目标是贝卡斯所拥有的千年眼。

决斗者王国的战斗结束了，城之内把奖金拿到手，海马兄弟也平安重逢，住院的贝卡斯把一张名为“友情的羁绊（友情の绊）”卡寄给了游戏。恢复了意识的双六迎接游戏等人的回来。可是出现在双六面前的是仅12岁的全美冠军蕾贝卡……！武藤游戏VS蕾贝卡

决斗：武藤游戏VS蕾贝卡

海马公司的五巨头开发的这个决斗怪兽为基础的冒险游戏向海马发起挑战。海马的意识被数据化关在电脑世界里，只要游戏尚未通关，海马就一直在电脑世界徘徊。

为了营救海马，游戏、城之内、圭平也进入了“DM冒险游戏”的电脑世界。这时他们竟然遇到了孔雀舞。

游戏、城之内、孔雀舞、圭平乘飞机前往暗黑浮游城。迎击他们的是无数的怪物群。

双六的游戏店前新开张了一家游戏店，为此双六十分沮丧。同时，游戏班上来了一名神秘转学生——御伽龙儿。

新卡店的地下游戏场，为了帮助城之内，游戏接受了御伽的“怪兽龙门骰”挑战。御伽召唤出了大量怪兽；然而游戏召唤出来的怪兽只有1个，怪兽召唤变得困难成为劣势……。

御伽深信游戏使诈才会在决斗中赢了贝卡斯，为了守护那个名誉，只有在“怪兽龙门骰”打败游戏。游戏开始掌握““怪兽龙门骰””的诀窍，并且迅速理解其中深奥的妙趣。

游戏的场上已经没有可以召唤怪兽的场地。

决斗：武藤游戏VS基斯·霍华德

决斗：武藤游戏VS基斯·霍华德

童实野町古代埃及展。海马濑人得到了“欧贝利斯克的巨神兵”。

游戏和杏子约会。

暗游戏为了知道自己是谁，和杏子一起去了埃及展。另一方面，海马为了测试刚得到的神之卡的力量，和使用着自己原本卡组的机器人开始决斗。

海马要举办“战斗城市”的决斗大会，城之内却因等级过低而无法报名。这时古鲁斯罕贵卡猎人看中了城之内的“真红眼黑龙”，于是把城之内的等级上调。那夜，古鲁斯罕贵卡猎人埋伏着城之内的到来。决斗：城之内VS蕾雅卡猎人

“战斗城市”开幕式，出现了羽蛾、龙崎、渔汰等人的身影，海马发表演说，解说了比赛规则。于是大会开始了，游戏的第一个对方就是夺走城之内的“真红眼黑龙”的古鲁斯罕贵卡猎人！决斗：武藤游戏VS蕾雅卡猎人

游戏察觉到了对方是使用“艾克佐迪亚”特殊胜利的战术，游戏使出口胡战术与之对抗。决斗：武藤游戏VS蕾雅卡猎人

为了成为真正的决斗者，城之内离开游戏独自寻找决斗者挑战。城之内的第一个对手是打败了龙崎的絽场，此货自称拥有超能力。决斗：城之内克也VS超能絽场

城之内识破了絽场的诡计，还是处于下风。这时，城之内孤注一掷，采用自己最强的赌博战术。决斗：城之内克也VS超能絽场

游戏在某马戏团遇到了一名同样使用“黑魔术师”的决斗者，同时也是古鲁斯猎人的潘多拉。二人开始了决斗。决斗：武藤游戏VS潘多拉

游戏和潘多拉都召唤出了各自的黑魔术师，开始了黑魔术师之间的一场世纪较量。决斗：武藤游戏VS潘多拉

决斗：武藤游戏VS潘多拉。游戏的黑魔术师擅自灵魂脱壳保护了游戏，这时潘多拉召唤出第二只黑魔术师，而游戏召唤出了黑魔术少女反击。

城之内的决斗盘被某少年抢走了，虽然夺回来了但这一切全是阴谋。昆虫羽蛾出现向城之内发起挑战，决斗中城之内的卡组中出现了原本就没有的“寄生虫帕拉赛德”。城之内克也VS昆虫羽蛾。

城之内的怪兽全部因为“寄生虫帕拉赛德”而变成了昆虫族，被羽蛾使用“除虫网”封锁了攻击。虽然依靠天使之骰和恶魔之骰击倒了羽蛾的“究极完全态大飞蛾”，但而后羽蛾召唤出更加强大的“昆虫女王”。城之内克也VS昆虫羽蛾。

在前往战斗城市的船上的马利克利用千年杖的力量，操控着某人偶去挑战游戏。决斗：武藤游戏VS沉默的娃娃（马利克）

马利克利用“噩梦之铁栏”封锁了两个回合的攻击从而集齐了3只祭品，得以召唤出神之卡——“欧西里斯的天空龙”，使用“再生史莱姆”+“防御史莱姆”封锁游戏的一切攻击，使用“生还的宝札”+“无限的手札”使得神的攻击里无限上升，把游戏逼入绝境。决斗：武藤游戏VS沉默的娃娃（马利克）

被马利克的神之组合逼入绝境的游戏，在他面前出现的是海马濑人，因海马的话游戏召唤到了突破口。神的攻击力绝对不是无限，游戏反利用对方的卡片来获得胜利！决斗：武藤游戏VS沉默的娃娃（马利克）

游戏担心城之内而去寻找他，遇到了2名古鲁斯猎人的阻拦，和海马一起加入决斗。海马使出神之卡独自把二人击倒。与此同时，城之内在水族馆遇到了渔汰。

决斗：城之内克也VS梶木渔太

城之内终于获得了决赛的出赛权。这时，住院的城之内的妹妹静香打来电话，说自己眼上的绷带可以取下了，想要观看哥哥的决赛表现。然后，城之内遇到了马利克扶着的受伤的貘良了。游戏在寻找城之内，遇到了古鲁斯的猎人——光之假面、暗之假面。

古鲁斯（グールズ）的光之假面·暗之面具的双打决斗者和游戏·海马战斗着，他们使出陷阱卡“遗言之假面”封锁了对神之卡的召唤。

古鲁斯（グールズ）的光之假面·暗之面具的双打决斗者和游戏·海马战斗着。游戏的使出“手卡抹杀”、海马使出“死者苏生”，“青眼白龙”得以召唤成功！

对团结的力量所有理解的海马，为了游戏召唤出王牌而把青眼白龙作为炮灰，然后游戏的“磁石战士电磁武神”但是，光之假面・暗之假面豪不害怕？察觉到敌人的策略的游戏，想海马说要冷静判断。然后，和预想的一样，敌人使用“遗言之假面”的力量游戏的磁体战神夺去了！但是，这也是游戏和海马的作战策略。两个人团结的力量，终于召唤了神的卡…!?

游戏和海马打倒了光/暗之假面后，为了搭救杏子而坐只直升机前往童实野码头。

在童实野码头，等待着游戏的是被马利克洗脑的城之内。为了救回城之内，游戏不得不答应和城之内决斗。

暗游戏和被马利克洗脑的城之内的决斗持续着，城之内使用禁卡“火球”给予游戏直接伤害。暗游戏苦恼着怎么才能夺回城之内的心，这时原本人格的武藤游戏站出来了！

和城之内在决斗者王国一起奋战的“真红眼黑龙”，游戏把他召唤出来，用它来攻击被洗脑的城之内。

游戏和被马利克洗脑的城之内的决定终于迎来了最后的阶段。游戏和城之内都剩下一点基本分，游戏不忍城之内落败，仍然使用“精灵之镜”把“死亡流星”的效果给了自己。

为了参加战斗城市决赛，受伤的貘良从医院逃出来，此时遇上了鬼骨冢等人。貘良的超自然卡组对抗着鬼骨冢的幽灵卡组。

在前往战斗城市决赛会场的游戏、城之内、孔雀舞等人途中，好莱坞明星约翰・克劳德・梦龙出现在他们面前。梦龙为了完成“只要我赢了你，你就要和我结婚”的约定向孔雀舞发起挑战。

通过预选赛的决斗者们相继到达了将在战斗城市进行决胜淘汰赛的童实野体育场。这时获得淘汰赛资格的有7名决斗者：海马濑人、武藤游戏、城之内克也、孔雀舞、隐藏身份的马利克、伪装成马利克的利希德和与马利克有暗中交易的暗貘良。真正的决赛舞台——飞行船“战斗船”出现在大家面前。

战斗城市决赛的会场是在童实野市上空飞翔者的“战斗船”。第一轮淘汰赛终于开始了，通过抽签决斗各自的对手。第一轮比赛由貘良了对战武藤游戏，决斗中貘良却是使用消极防御战术 ？

貘良召唤的“暗黑人偶妮可罗菲娅”被游戏打倒了，貘良得以发动场地“暗黑圣域”，并配合“威加盘”的特殊胜利战术。

貘良破解了游戏的策略，走头无路的游戏不得不使用神之卡——“奥西里斯的天空龙”。这时暗貘良却听从马利克的建议，把原本人格的貘良了放出来···

战斗城市淘汰赛中，游戏击败了貘良，但貘良因此身受重伤并陷入昏迷。静香的“人的生命应该比决斗更重要”的话打动了海马，决斗派遣医疗队伍到“战斗船”上来为貘良治疗。

战斗城市淘汰赛第二轮，由城之内对战伪装成马利克的利希德。因为曾被马利克洗脑的城之内，誓要将要将马利克打倒。利希德采取不断布下陷阱的战术，而城之内不断地召唤出怪兽，意图把对方的陷阱卡一次性清除后发起总攻击。

城之内和利希德的决斗持续着，利希德召唤出3只陷阱怪兽“阿匹卜之化神”向城之内发起攻击使得城之内的LP降至200。准备投降的城之内因孔雀舞和静香的鼓舞，回想起在决斗城市遇到的对手们，找出了继续战斗的勇气，召唤出了在战斗城市预赛中获得的“人造人索加”打破僵局。

被城之内紧逼着的利希德终于召唤出了最后的王牌“圣兽塞勒凯特”，不断把城之内的怪兽击倒，城之内无计可施。城之内决定承受对方的攻击而败北，因为确认对手是一个堂堂正正的真正的决斗者，而不是奸恶的马利克。

为了证明自己是马利克，利希德决斗召唤“太阳神之翼神龙”。然而召唤出复制卡确激怒了真正的太阳神，太阳神的一击使得利希德和马利克同时晕倒。这时谁最先醒过来谁就能获得比赛胜利！

战斗城市淘汰赛第三轮，由孔雀舞对战马利克。此时因为利希德的昏迷使得对马利克体内黑暗人格的抑制减弱，，熊抱化的暗马利克觉醒。孔雀舞拒绝游戏、城之内等人的声援，打算独自应战。

黑暗游戏逐渐使得孔雀舞陷入“孤独”的世界，因游戏的话语而重新振作起来。孔雀舞熟练着操纵着亚马逊卡组，成功地把马利克手里的“太阳神之翼神龙”夺取。

孔雀舞召唤出了“太阳神之翼神龙”，但因读不出召唤台词，“太阳神”只能维持球体形态而无法作出攻击。这时，暗马利克读出了写在“太阳神”卡上的古代神官文字（召唤台词），使得“太阳神”站到了暗马利克的场上

战斗城市淘汰赛第三轮，由海马濑人对战从未露面的第八名决斗者。出现在海马面前的是马利克的姐姐、也是把“欧贝利斯克之巨神兵”交给海马的人——伊西丝·伊修达尔。

海马的行动完全如伊西丝所预测的那样。海马的卡组被伊西丝的破坏了，但还是召唤出了“欧贝利斯克之巨神兵”。准备作出最后一击时，海马作出把神献祭的举动。

到此为止，进入半决赛的4名决斗者全选出了——武藤游戏、城之内克也、马利克和海马濑人。海马在监控室分析着“太阳神之翼神龙”卡上的文字；另一方面，游戏、城之内去病房探望孔雀舞蹈，这时伊西丝·伊修达尔出现在他们面前，开始讲述了守墓一族的惨剧。

为了夺回身体，原本人格的马利克向暗貘良提出合作。为了得到千年杖，暗貘良向暗马利克发起挑战。暗貘良成功地把暗马利克的“太阳神之翼神龙”夺到手里，意图召唤出来。

暗貘良成功地召唤出了“太阳神之翼神龙”，但攻击力竟只有0。暗马利克使用“死者苏生”把“太阳神之翼神龙”复活到自己场上，并使出了“太阳神”的最后形态——决斗者和神融合的形态，向暗貘良发起最后一击。

游戏他们乘坐的“战斗船”正前往着决赛的舞台——阿尔卡特拉斯岛（アルカトラズ岛）。但是到达之前，“战斗船”偏离的航线，因为系统被一名名为乃亚的少年控制住。大伙不得不登陆海上漂浮的巨大要塞。“统领卡规则”的战斗在等待着他们。

游戏他们接受海马公司五巨头的挑战，进入了虚拟世界。在沼泽地带，游戏遇到了“深海战士”装扮的五巨头之一的敌人大下幸之助。游戏的“栗子球”擅自跳出来作为统领怪兽，游戏和“深海战士”的决斗就此开始。

“深海战士”的统领卡能力，通过把2只怪兽献祭把游戏的攻击反弹，而且这货深谙卡差的道理而不断地补充消耗了的怪兽，使得一味亏卡的游戏陷入苦战。

不再采取防御反击战术的“深海战士”开始亏卡了，召唤出了怪兽对游戏最后一击时却被游戏的统领怪兽“栗子球”挡下了攻击。然后，游戏开始反击了。

一个人在荒野行走着的杏子遇到了企鹅，并被带到了冰原地域，这里等着她的是装扮成“梦魇企鹅”的五巨头之一的敌人大泷修三。杏子选择“黑魔术少女”作为自己的统领怪兽，然而她的卡组没投入黑魔术师···

杏子和“梦魇企鹅”的决斗持续着，杏子使出了“摩诃毗卢”+“魔术咒文书”开始了反击，不过很快又被对方压制住，这时“黑魔术少女”站出来。

在虚拟世界徘徊的城之内，装扮成孔雀舞的五巨头之一的海马公司法律顾问大冈筑前。大门化身成“审判者”在法庭场地和城之内开始了决斗，城之内选择了“炎之剑士”作为统领卡。在决斗之初，城之内就不断使用“炎之剑士”的统领效果而向对方发起强攻。

因为“审判者”的统领效果，城之内的怪兽全灭。有因为对方的作弊机制，使得城之内的赌博战士屡次失败，以为胜利女神离自己远去。这时乃亚出现道出了大冈的卑鄙行为。得知真相的城之内又开始赌博了( ╯□╰ )

在虚拟世界徘徊的本田、静香、御伽3人来到了一间工厂，这时化身成“机械军曹”的五巨头之一的敌人大田宗一郎出现在他们面前想他们3人发起挑战，然而3人在打牌方面全是新手，静香更是第一次接触，完全不懂规则。“机械军曹”盯上了静香发起攻击，这时本田站出来舍身相救。

本田为了救静香、承受对方的攻击而落败，然后就消失了；受到打击的静香无法继续，御伽决定反击，使出自己擅长的“骰子迷宫”战术，然而这在打牌里行不通。对方召唤出“完美的机械王”进一步追击，连御伽也奄奄一息。受到鼓舞的静香重新站起来决斗。

海马和圭平受到了获得本田身体的大田宗一郎的袭击，这时一只机器猴子出来保护海马。这时猴子便是本田失去身体后的姿态。圭平被拐走，海马前去追击。这时，堵在海马面前的化身“人造人索加”的五巨头之一的敌人大门小五郎。 “人造人索加”拥有破坏陷阱的能力，使得海马陷入苦战。

大门小五郎召唤出了“卫星加农炮”——这个以海马养父海马刚三郎制造的离地面3万6千公里的上空的军事卫星为原型的机械族决斗怪兽。

海马乃亚催眠了海马濑人的弟弟圭平，让圭平成为自己的弟弟。

占据本田身体的五巨头出现在游戏和城之内面前，向他们发起挑战。

（被攻击的城之内 迈向胜利的关键决斗）游戏&城之内VS五巨头的决斗持续进行着，五巨头打算集中火力对付最弱的城之内。

五巨头终于召唤出了王牌怪兽——五帝龙，但马上就被游戏的幻影之骑士秒杀。打不死的五巨头召唤出另一只“狂暴死龙”向游戏发起猛攻，这时城之内用自己的“炎之剑士”保护游戏，并为此打开胜利之门。

为了救回弟弟圭平，海马和乃亚的决斗开始了。乃亚不断使用魔法·陷阱卡破坏海马的怪兽，但海马的“吸血鬼总督”拥有不断复活的能力。

乃亚的统领卡“奇迹方舟”的特殊能力终于起动了，把送去墓地的卡全部收容。海马发起强攻时，乃亚使用“奇迹方舟”召唤出怪兽抵抗攻击。面对乃亚的消极防御战术，海马使用“龙之逆鳞”赋予贯穿伤害决定胜负！

将要落败的乃亚终于使诈了，让圭平抵挡海马的攻击，使得海马无法出手。为了唤醒圭平，海马召唤出了充满二人回忆的“青眼白龙”，并使用“最终一战！”让双方指定2只怪兽单挑来决定胜负；乃亚派出的“奇迹方舟”露出真身。

乃亚赢了海马后，把海马兄弟变成了石像。愤怒的游戏捡起了海马的卡组和自己和卡组混在一起，继承海马的基本分以及空场空手卡的状态向乃亚发起挑战。乃亚使出了灵魂怪兽向游戏发起攻击，而游戏使用“电子壶”发起反击。

熬过了乃亚的攻击，游戏召唤出了“黑魔术三剑客”——黑魔术师、黑魔术少女、黑混沌之魔术师发起总攻击，但被乃亚瞬间瓦解，最终双方LP达成一万比一百的差距。这时，因同伴的力量，游戏使出了青眼究极龙！

游戏使用3只“青眼白龙”直接攻击击倒了乃亚，变成石像的众人也恢复了原样。这时海马公司的创建者海马刚三郎突然出现在大家面前。原来刚三郎在死前把自己的意识移植到了虚拟世界。

海马要和刚三郎作个了解，于是独自和刚三郎进行决斗。决斗中，刚三郎使出了曾经打败过海马的艾克佐迪亚——的亡灵。

海马打败了刚三郎，和众人一起成功地离开了虚拟世界，脱离的海上要塞。

一番折腾，终于到达了战斗城市半决赛的舞台——人工岛。游戏、海马、城之内，马利克4人进行混合战来决定之后各自的对手。

游戏想要和城之内对战，城之内则一心想找马利克复仇。海马和马利克都想要先战胜游戏来获取游戏的神之卡，一直盯着最弱的城之内来打。

四人混战持续进行着，城之内成功地最先把马利克的LP归零。游戏理解了城之内的对马利克的“心意”，决定成全他们。

半决赛第一战，由城之内对战暗马利克，同时这也是一场黑暗游戏，决斗怪兽的生命力、体力和决斗者本人同化。马利克使用“被埋葬的牲祭 ”召唤了“地狱诗人”。

“地狱诗人”被城之内击倒了，然而“地狱诗人”的恐怖能力也得以发挥：每个回合把城之内手上的1张卡夺取墓地。暗马利克使用陷阱卡折腾城之内，城之内又用“人造人索加”开始了反击。

城之内的“人造人索加”被“熔岩魔神”吃掉了，城之内的怪兽全部被马利克的“万力魔神”折磨着。城之内召唤出了“闪电之战士吉尔福德”大反击。

马利克使用“死者苏生”复活了“太阳神之翼神龙”，使出“不死鸟形态”消灭了城之内的“闪电之战士吉尔福德”使得城之内身体、精神上受到极大的损伤！

半决赛第二战，由海马濑人对战暗游戏。海马为此准备了特别舞台——圆形竞技场。

海马濑人集齐了XYZ三只怪兽，眼看下回合就可以召唤出神，却被游戏先集齐祭品得以召唤出“奥西里斯之天空龙”。

海马也召唤出了“欧贝利斯克的巨神兵”，和游戏的“奥西里斯之天空龙”对峙着。

两神同归于尽，海马和游戏的决斗继续进行着。游戏召唤出“黑魔术师”，而海马召唤出了“青眼白龙”。

海马通过“呼龙笛”召唤出了2只青眼白龙，向游戏的黑魔术师袭来。这时游戏也把自己手上的真红眼黑龙“顺势”召唤出来。

海马和游戏的决斗终于迎来了决定胜负的时刻，海马召唤出了“青眼究极龙”，而游戏召唤出了“超魔导剑士-黑暗帕拉丁”。

城之内重昏迷中醒过来了，得知游戏赢了海马。于是为了和海马分出谁是第3名而向海马发起挑战。海马使用“死之卡组破坏病毒”伺候之。

城之内卡组中的高攻怪兽全被送去墓地了，单独一只“刀锋骑士”也让城之内陷入苦战，然后海马召唤出“青眼白龙”。

终于迎来胜负的时刻，城之内把此赌在“时间魔术师”上。

战斗城市总决赛，武藤游戏对战暗马利克。二人的黑暗游戏，把各自的原本人格也拖到了战场。

游戏召唤出的“奥西里斯之天空龙”被暗马利克的“太阳神之翼神龙”的“不死鸟形态”烧死。暗马利克再次召唤出“太阳神之翼神龙”并使出“融合形态”向游戏发起攻击时，游戏发动了“恶魔圣域”！

“恶魔圣域”瞬间被暗马利克破解，但游戏也得以召唤出“欧贝利斯克的巨神兵”向暗马利克发起人身攻击。吃下了4000LP伤害的暗马利克得以发动陷阱卡“金属反射史莱姆”复制“欧贝利斯克”，再和“再生史莱姆”融合使其获得不死的能力。即使是“欧贝利斯克”也未能将其击倒。

因“神之史莱姆”的不死能力，游戏无法有效攻击。同时，游戏思考着击倒暗马利克同时救出表马利克的方法。暗马利克再次召唤出了“太阳神之翼神龙”，游戏发挥出了“欧贝利斯克”的最终能力与之抗衡！

利希德苏生过来，来到了游戏和暗马利克决斗的会场。

战斗城市大赛终于落下了帷幕，然后海马留下了“一小时之后人工岛就会自爆”的话离开了。然而战斗船已经坏了，大家无法离开人工岛···

总结篇。略。

游戏来到了美术馆的埃及展，把3张神之卡向石板展示时，石板突然冰洁化，同时大批实体化的决斗怪兽出现了街头引起恐慌。那晚，游戏的3张神之卡突然被某人夺走。

游戏和夺走神之卡的神秘人古力摩的决斗持续着，游戏成功地击倒了被对方操作着的“欧贝利斯克的巨神兵”。然而，拥有操作神之力的“奥利哈刚的结界”的神秘力量让人不安。

游戏虽然击败了神秘人古力摩，但3张神之卡却被多玛的三剑客抢去。次日，蕾贝卡和他的爷爷霍普金教授出现在游戏面前，说了最近的海底调查中发现了1万多年前的遗迹之事。夜间，游戏听到了“黑魔术少女”的救助去了精灵世界，因此获得了无名之龙蒂迈欧的力量。

贝卡斯又给游戏寄来了录像带，这次要求游戏到美国找他。

以公司控股为威胁，海马濑人不得不来到决斗者王国再次和贝卡斯进行决斗。贝卡斯使出了拿手的“卡通世界”战术。

　眼前的贝卡斯只是伪装而成的多玛三剑客之一的亚美鲁达，他对海马充满着仇意。亚美鲁达使出了“奥利哈刚的结界”，把海马的2只青眼白龙夺取。

游戏、城之内、本田、杏子四人来到了美国，遭遇了摩托车混混的围堵，被一名使用“神鹰女郎”的女车手救出。城之内相信她是孔雀舞。

孔雀舞使出了“奥利哈刚的结界”把城之内围住，城之内不得不迎战。熟练地使用“奥利哈刚的结界”和“神鹰女郎”的孔雀舞，把无心应战的城之内逼入绝境。

城之内和孔雀舞的决斗持续进行着，城之内终于打气精神全力以赴地迎战，然而他的赌博战术并不能持续多久。这时，一只被冰封的巨龙突然出现在城之内面前。

城之内获得了第三只无名之龙赫谟的力量，使用“赫谟之爪”和“时间魔术师”融合出“时间魔术锤”向孔雀舞发起反击。

雷贝卡的爷爷霍金斯教授被拉菲鲁绑架了，拉菲鲁给游戏留下了明日约战的纸条。

游戏独自一人到来的死亡峡谷，接受拉菲鲁的挑战。

游戏使用“栗子球”五兄弟的效果了拉菲鲁的追杀，然后召唤出了“黑魔术少女”并使用“蒂迈欧之眼”融合出“龙骑士黑魔术少女”。

无计可施的游戏发动了“奥利哈刚的结界”，“蒂迈欧”因此消失。游戏意图借助“奥利哈刚的结界”的力量打败拉菲鲁。面对游戏的疯狂攻击，拉菲鲁终于召唤出了王牌怪兽“守护者·艾托斯”。

游戏败给了拉菲鲁，原本人格的游戏代替暗游戏被“奥利哈刚的结界”夺取了灵魂。另一方面，一心想要变强的羽蛾和龙崎追着拉菲鲁的直升机。

在无人列车的车顶，游戏开始和羽蛾的决斗。在荒野，城之内开始了和龙崎的决斗。

为了复仇的羽蛾和龙崎，获得了“奥利哈刚的结界”。

城之内使用“赫谟之爪”的力量和“真红眼黑龙”结合，从而战胜了龙崎。另一方面，游戏使用“蒂迈欧之眼”向羽蛾反击却发动不了，这时羽蛾作出了激怒游戏的举动而惨遭鞭尸。

游戏和杏子遇到了神秘老人铁心，在他带领下来到了“石之荒野”。在这个死灵之地，暗游戏遇到了原本人格的游戏。两个游戏开始了一场决斗。

在“石之荒野”，“奥利哈刚战士”出现在游戏面前。面对拥有再生和强化能力的“奥利哈刚巨灵”，游戏必须借助“蒂迈欧”的力量。

多玛三剑客之一的巴龙追求着孔雀舞。这时路过的蕾贝卡和御伽向巴龙发起决斗挑战。先攻的巴龙召唤出了攻击力0的盔甲怪兽。

在海马兄弟乘坐的专用喷气式飞机上，亚美鲁达突然出现。海马和亚美鲁达的决斗再次开始。

亚美鲁达召唤出了王牌怪兽“魔空要塞”。这时喷气式飞机开始不稳定了。

海马和游戏相会。

巴龙用摩托车把城之内一人引导过来，和情敌城之内的决斗终于开始了。

城之内和巴龙的决斗持续着。

城之内终于使出了“赫谟之爪”，然而未能因此战胜巴龙。面对巴龙的盔甲怪兽，城之内也让怪兽和自身结合来应对。城之内穿上“真红眼黑龙”的盔甲化身成“真红王”。

城之内和巴龙的决定迎来最激烈的时刻，在一旁观看的孔雀舞也热血起来。城之内战胜巴龙后，马上对孔雀舞发起挑战！

城之内和孔雀舞的决斗持续着。

孔雀舞战胜城之内后，打算脱离多玛而向拉菲鲁要见BOSS达姿。游戏等人来到多玛的大楼时，遇到的是被拉菲鲁打败后失去灵魂的孔雀舞。游戏乘电梯来到楼顶，这里等待他的是多玛三剑客最后一位——拉菲鲁。

拉菲鲁使用了“奥利哈刚的结界”强化了自己的“守护者”怪兽并召唤出了王牌“守护者·艾托斯”。防守住猛烈攻击后的游戏召唤出了“咒符龙”消灭“艾托斯”，这时拉菲鲁得以召唤出更加强大的“守护者·戴思塞斯”。

面对“守护者·戴思塞斯”的不死能力，游戏不断使用“黄泉天轮”的效果复活怪兽来防守。最后游戏选择复活“守护者·艾托斯”对抗拉菲鲁，并赌上城之内的“赫谟之爪”的能力。

根据拉菲鲁所给的地图，得知了达姿的所在地，于是游戏、海马等人乘坐直升机来到了南方大海上的一个孤岛。岛上的暗黑神殿里存放着寄有败者的灵魂的石板。于是，游戏和海马对战达姿的决斗开始了。

游戏和海马召唤出了“究极龙骑士”向达姿发起直接攻击，然而达姿毫发无损。达姿召唤出仪式怪兽“奥利哈刚的反射镜”并特召出4只“反射镜子骑士”向游戏、海马的怪兽发起攻击。

海马破坏了“奥利哈刚的反射镜”，4只“反射镜子骑士”的真面目竟然是游戏、城之内、孔雀舞和贝卡斯的灵魂。暗游戏无法对他们发起攻击，虽然海马毫无顾忌地发起攻击，但“反射镜子骑士”的特殊能力实在难缠。

达姿发动了第三重结界“奥利哈刚之气”。海马使用“克里底亚之亚”的力量召唤出了“反射镜力龙”全灭达姿的“反射镜子骑士”，然后达姿召唤出强大的怪兽——西诺洛斯向海马袭来。

海马牺牲了，留下游戏独自对抗达姿。面对攻击力2万的西诺洛斯，游戏只能采取防守。这时，游戏抽出了贝卡斯那里获得的一张卡“传说之心”——拥有解锁“传说之龙”姿态能力的卡片。

游戏消灭了达姿的西诺洛斯，但达姿进一步召唤出攻击力无限大的蛇神彝，游戏使用“魂之接力”召唤出“黑魔术少女”使自己免于落败。传说的三骑士，向达姿的蛇神彝发起了最后攻击！

游戏、海马、城之内3人来到了巨大城市亚特兰蒂斯上，以奥利哈刚之神为对手，召唤出各自的决斗怪兽。

游戏召唤出三幻神打倒了奥利哈刚之神，被吞噬了的灵魂也回到各自体内。这时，集地球上所有的心中的黑暗力量向游戏袭来。

游戏他们突然发现没有返回日本的旅费了，于是答应圭平参加了海马集团举办的KC杯大赛。圭平带着大伙到海马乐园参观，当他们进入决斗会场时，因某人的黑客行为而被混在了决斗会场。

暗游戏使用极度不平衡的由大量龙族通常怪兽组成的卡组，以最高等级的电脑为对手而陷入苦战；这时游戏抽到了“凡人的意志”。

KC杯A组第一场比赛，城之内的对手是面具人洛克，这位洛克的真实身份其实是游戏的爷爷——城之内的师傅——武藤双六。决斗中城之内使出擅长的骰子战术，但被双六破解了···

决斗：城之内VS面具人·洛克（武藤双六）。城之内因对方的永续陷阱卡“旅人的试练”而无法攻击，这时面具人洛克趁机召唤出了梦幻的王牌怪兽“古代龙”。

KC杯B组的比赛，作为全美冠军的少女蕾贝卡·霍普金，她的对手是亚洲霸者的美女决斗者薇薇安·王。另一方面，羽蛾和龙崎乱入大会，他们的对手是华丽的决斗者奇古·罗伊德。

KC杯前8强名单出炉了，城之内接着的对手是战胜了羽蛾&龙崎的奇古·罗伊德，二人的决斗在火山地区进行。这时圭平来告诉游戏他们，有黑客混进了决斗者当中。

决斗：城之内VS奇古·罗伊德。城之内的“人造人索加”被破坏掉并承受4只“女战神”怪兽的直接攻击，但因魔法卡的作用而残余一点基本分。这时奇古·罗伊德使出了“三女神”卡片，不断抹杀城之内卡组中的怪兽和干扰城之内的抽卡。

蕾贝卡成功进入四强，她下一轮的对手是雷恩·哈尔特。二人的决斗在小人国进行。另一方面，游戏等人得知双六失踪了，为了寻找双六而没法去给蕾贝卡打气。

决斗：蕾贝卡VS雷恩。薇薇安以双六为要挟，要和游戏进行决斗。另一方面，蕾贝卡和雷恩的决斗也进入尾声。

KC大奖赛最后决赛雷恩·哈尔特对战奇古·罗伊德。这时海马乱入，道出奇古的黑客行为，宣布取消奇古的参赛资格。奇古不服，海马要求和他进行决斗。

决斗：海马濑人VS奇古·罗伊德。奇古使出了“三女神”卡片对付海马，反而帮助了海马堆墓和解决卡手问题，让海马更快地召唤出“青眼白龙”。这时奇古说出了自己憎恨海马的理由。

因为奇古被剥夺参赛权，雷恩·哈尔特成为了KC杯冠军，获得了和武藤游戏对战的权力。然而这个雷恩其实是奇古的弟弟，背负了家族命运，誓要打败武藤游戏。

雷恩使用了奇古给他的禁卡“修特姆·贝洛克的黄金城”，使得海马公司的电脑被病毒感染。

游戏巧妙地利用无法维持COST而自爆的特性把“修特姆·贝洛克的黄金城”破坏掉了，然而游戏的卡组还剩1张卡。

游戏的爷爷双六给游戏讲述自己在埃及地下古墓通过黑暗的死亡游戏而获得千年积木的故事（1960年）。

暗貘良帮助游戏截下了盗走神之卡和千年神器的羽蛾和龙崎，自行取走了千年轮。为了在即将的终究黑暗游戏中胜出，暗貘良出现在海马濑人面前，二人开始了黑暗决斗。

游戏他们来到了埃及。当游戏把3张神之卡举向石板时，暗游戏进入了记忆世界开始了记忆之旅。当他醒来时，发现自己是年轻的法老王，身边是7位神官。

盗贼王貘良盗取了上代法老王的陵墓并拖着棺材来到了年轻法老王的王国，7位神官们召唤出了各自的魔兽和貘良开始了对决！另一方面，游戏和他的朋友们进入千年积木的迷宫，为了寻找暗游戏的真实之门。

七位神官被貘良打得体无完肤，法老王召唤出神与貘良对打也只是平手。神官之一马哈德决斗解放自己的魔力独自对抗貘良。

马哈德把貘良引诱到自己修炼魔法的地宫，二人开始了一番决斗！

游戏他们通过的迷宫来到了法老王的记忆世界，在这里谁也看不见他们。另一方面，神官塞特到处搜索拥有强力魔兽的人，遇到了拥有白龙的女性琪莎拉。

神官阿克纳帝回忆起自己当年制造七神器而牺牲百姓的温馨故事。另一方面，法老王骑着白马、驾驭着天空龙追缉着盗贼王貘良。

“奥西里斯的天空龙”被盗贼王貘良的“迪尔邦杜”打败了，元气大伤的法老王看见了游戏等人虎重新振作起来，召唤出了“太阳神之翼神龙”击倒貘良。这时，突然时间倒流···

阿克纳帝把白龙女琪莎拉和死犯关在一起，让他们厮杀试图引出青眼白龙，塞特乱入。另一方面，跌入谷底的法老王梦见了父亲。

得知了盗贼王貘良的所在地后，法老王马上前往，那里便是因制造七神器而死去的人们的村落。

法老王召唤出的黑魔术师、玛娜召唤出的黑魔术少女一起对砍盗贼王貘良，众神官也加入战斗誓要把貘良刨皮。另一方面，游戏等人开始寻找法老王的真实之名

在地下神殿杀死了盗贼王貘良的众人突然变得不能行动，阿克纳帝把七神器收集起来放入石板试图找出大邪神，然后阿克纳帝化身成黑暗大神官。记忆世界的一切其实是暗游戏和暗貘良进行的一场究极的黑暗PRG。

黑暗大神官把亲儿子塞特带走了。另一方面，游戏等人来到了法老王的陵墓。

盗贼王貘良满血复活啦，把法老王和神官们分散，召唤出魔神侍候他们。

阿克纳帝要求塞特杀死琪莎拉以获得白龙的力量，塞特拒绝；然而琪莎拉为保护塞特特而被黑暗大神官杀死。法老王赶到时，遇到的是被黑暗大神官附身的赛特。

在王墓里，游戏和貘良的决斗开始了。游戏使用“棉花糖”防御貘良的攻击，使用“沉默剑士”向貘良发起攻击。另一方面，大邪神佐克终于复活了，向众神官袭来。

游戏和貘良的决斗持续着，貘良发动了“诅咒的双子人偶”取消自身墓地的存在，使得死去的怪兽以浮灵形态出现在场上。另一方面，神官VS佐克的战斗中，西蒙召唤出了艾克佐迪亚对抗佐克。

游戏和貘良的决斗持续着，貘良发动了永续魔法“死札相杀”破坏游戏的卡组，终于游戏的卡组只剩下一张卡。另一方面，取回千年积木的法老王召唤出三幻神对抗佐克。

游戏和貘良决斗中，游戏进行最后抽卡，召唤出了“破坏龙甘多拉”破坏了貘良场上的所有卡，“沉默剑士”的攻击一击击倒了貘良。另一方面，佐克轻易地把法老王的三幻神全灭；这时海马赖人出现，召唤出“青眼究极龙”与佐克抗衡。

究极的黑暗RPG进行最后时刻了，游戏等人赶来支援法老王，并向法老王传达了他的真实之名——阿图姆。阿图姆使出最后的力量使三幻神复活并合体成“光之创造神”！

阿图姆和游戏他们回到了现实世界的埃及，集齐了7件千年神器。为了打开冥界之门送阿图姆回地狱，必须继续决斗的仪式。城之内和海马都想要和阿图姆决斗，然而游戏决斗阿图姆的对手是自己。

来到冥界的神殿，将七神器放入石板，此时阿图姆和游戏分成2个人，然而二人的命运的决斗开始了。游戏召唤出了三色齿轮和攻击力3000的陷阱怪兽“机动城堡垒 ”。

阿图姆召唤出了“欧贝利斯克的巨神兵”击倒了游戏的“机动城堡垒”，紧接着有召唤出“奥西里斯的天空龙”和“太阳神之翼神龙”。游戏召唤出“沉默剑士”和“磁石战士电磁武神”与之对抗。

游戏用陷阱卡“磁力（マグネット·フォース）”把“奥西里斯的天空龙”的召雷弹效果反弹，一回合内把阿图姆的三幻神全灭。然后阿图姆召唤“有翼幻兽奇美拉”“暗黑魔族基尔法恶魔”“疾风的暗黑骑士盖亚”、游戏召唤出“破龙剑士”“恶魔召唤”“诅咒之龙”进行一番拉锯战。

阿图姆终于召唤出最强的仆人“黑魔术师”。游戏使用“封印之黄金柜”把一张未知卡封印；在阿图姆发起攻击时使用“魔法师的法阵”把“沉默魔术师”召唤出来，并用“天降的宝札”强化“沉默魔术师”从而击倒阿图姆的“黑魔术师”，这时，阿图姆使用“死者苏生”意图复活“奥西里斯之天空龙”。