Hvězdná brána - Hluboký vesmír

Luciánská aliance stále drží kontrolu na palubě Destiny. Plukovník Young je však odhodlán loď dobýt zpět. Pověří tým, který vede poručík Scott, aby vymysleli, jak převzít kontrolu nad palubním počítačem. Když se tak děje, tak jeden z nepřátel jménem Varro přesvědčuje plukovníka Younga, aby zbylé členy Luciánské aliance ušetřil. Ten souhlasí a posílá na Zemi pro zkušené doktory, aby ošetřili raněné. Brzy se na lodi zapíná odpočet před skokem do hyperprostoru. Mezitím se Tamara probírá na neznámé planetě s narozenou dcerou.

Plukovník Young a doktor Rush jsou zpátky ve velení Destiny a zbývající členové Luciánské aliance jsou drženi ve vazbě. Sice se nezdají jako by chtěli moc spolupracovat, ale problémy zatím nedělají. Daleko větším problémem je nedostatek potravin a zásob pitné vody. Doktor Rush nyní ovládá kompletně celou loď a všechny její systémy. Tak může dostat Destiny z hyperprostoru, aby mohly být prozkoumány nejbližší planety kvůli potravinám. Ovšem při expedici na jednu z planet dochází ke katastrofě, což vyústí ve smrt jednoho člena posádky.

Při výstupu z hyperprostoru nachází Destiny a její posádka neznámou antickou loď. Rozhodují se, že se s lodí spojí a stáhnou její lodní data. Když tak učiní, tak zjišťují, že je to rozsévací loď hvězdných bran. Problém nastává ve chvíli, kdy ta loď začne z Destiny odčerpávat energii. Mezitím plukovník Young propouští členy Luciánské aliance, kteří jsou stále pod dohledem. Ale ne všichni jsou problémoví, tak jako Simeon.

Eli spěchá na Zemi za použití komunikačních kamenů poté, co obdržel zprávu, že jeho matka byla hospitalizována v kritickém stavu. Zjevně přestala brát své léky z deprese, že se svým synem již není delší dobu ve spojení. Tak se Eli musí rozhodnout, zda jí řekne pravdu. Na Zemi se dostává i Camile Wrayové, která navštěvuje svoji přítelkyni. Brzy ale zjišťuje, že s ní není všechno v pořádku. Současně na palubě Destiny si všichni musí zvykat na nové členy posádky z řad Luciánské aliance.

Během expedice na jedné planetě je poručík Scott infikován neznámou infekcí, která se šíří po jeho levé ruce. TJ zkouší vše, aby infekci zastavila, ale nedaří se. Poručíkovi tak hrozí, že o ruku přijde. Plukovník Young jim zakazuje vrátit se na palubu Destiny, aby se infekce nešířila dál mezi posádku. Během infekce začíná poručík blouznit a má halucinace, při kterých se vrací do Cloverdale, kde je ženatý s Chloe. Současně na planetě čelí skupina novému ohrožení díky rostlinám, které se zdají být agresivnější, než se původně zdálo.

Když se plukovník Young vrací ze Země, kde pomocí komunikačních kamenů mluvil se svoji ženou, je trochu mimo sebe, protože se chce jeho žena nechat rozvést. Z této situace se snaží vyspat a odpočinout, což mu ale nedovolí jeho sny, kde Destiny je ohrožována mimozemskou rasou Nakaiů, kteří chtějí Chloe nazpět. Mezitím se Eli seznamuje s jednou členkou Luciánské aliance, ve které nachází spřízněnou duši.

Doktor Rush nechává Destiny vystoupit z hyperprostoru. Poblíž se nachází ztroskotaná a skoro zničená loď, u které Rush zaparkuje. Posádka ho podezřívá, že Rush neříká celou pravdu. Na neznámou loď se vydává doktor Rush a plukovník Young, aby zjistili, jestli je funkční či jestli se dá opravit. Když motory nahodí, vzdálí se od Destiny tak daleko, že je skoro nemožné se k ní vrátit. Rush ve snaze zachránit jeho a ostatní musí své kolegyni Amandě Perryové prozradit, kde se nachází kontrolní místnost, o které ví jenom on.

Simeon zabíjí jednu členku aliance, která byla současně spojená s doktorkou Perryovou pomocí komunikačních kamenů. Současně si bere Lisu Parkovou za rukojmí, aby se mohl pomocí brány dostat na nedalekou planetu. Rozzuřený doktor Rush je odhodlán vydat se ho hledat. Posléze se k němu připojí i poručík Scott a seržant Greer. Mezitím na palubě Destiny musí Eli přijít na to, jak zpomalit odpočet před skokem do hyperprostoru, aby se tým mohl bezpečně vrátit na loď.

Při výstupu z hyperprostoru naráží Destiny na jeden ze známých raketoplánů se skupinou, která obydlovala planetu Eden. Dostávají povolení se nalodit. Na palubě je doktor Caine s jeho skupinou, kteří si však nic nepamatují. TJ doufá, že by s nimi mohlo být i její dítě, ale Caine si na její návštěvu nevzpomíná. Camile Wrayová přichází s myšlenkou, že za výpadek jejich paměti může nějaká mimozemská rasa. Proto navrhuje posádku zhypnotizovat.

Destiny zpozoruje během cesty nějakou energetickou stopu, která by mohla naznačovat existenci vyspělé rasy. Ovšem nacházejí jen pozůstatky z epické bitvy, která se tu kdysi odehrála. Plukovník Young sestavuje tým, který má za úkol jednu z lodí prozkoumat za účelem bližšího poznání jejich technologie. Nebezpečná situace nastává ve chvíli, když se hromada dronů probouzí ze spánku a zaútočí na Destiny. Posádka se tak poprvé seznamuje s novým typem technologie podobné replikátorům.

Když Destiny vystupuje z hyperprostoru, je opět napadena mateřskou lodí. Eli navrhuje plán, kdy by narušili jejich komunikační systém, což by je mohlo vyřadit z boje a posádce dát potřebný čas na opravy Destiny, které zaberou několik hodin. Mezitím Chloe prchá ze spárů svých věznitelů a vysílá do vesmíru signál pro pomoc.

Destiny se v současné době nachází ve velice žalostném stavu díky předcházejícím bitvám s drony. Eli přichází s plánem, který vymysleli s Ginn. Když bude Destiny prolétat hvězdou, bude mít dostatek energie vytočit bránou Zemi. Nápadem je nadšen plukovník Telford, ale doktor Rush je až příliš pesimistický, protože existuje až příliš mnoho anomálií, které by daný plán zhatily. Rush má tedy proslov k posádce o jejich misi a doufá, že přesvědčí nějaké dobrovolníky, kteří by v této misi pokračovali.

Když se Camile Wrayová a seržant Greer vracejí na Zemi za pomocí komunikačních kamenů zjišťují, že část vysoce postavených členů vlády spolupracují s Luciánskou aliancí, která plánuje v nejbližší době útok na Zemi. Právě v té době jsou oba uvěznění ve státní budově, kde vybuchla bomba a vyskytuje se tam vysoký stupeň radiace. Mezitím se na palubu Destiny dostávají doktor Covel a senátor Michaels, kteří se snaží vládu více zainteresovat do operace Icarus.

Je to již šest dní, kdy posádka Destiny ztratila kontakt se Zemí a vůbec netuší, zda byl Washington zničen po útoku Luciánské aliance nebo nikoliv. Jejich jediná šance je komunikace pomocí mimozemských kamenů. Dokonce se u nich i střídají směny. Když je tam Chloe, tak naváže spojení. Ne však s nikým ze Země, ale s Ginn, která byla před nedávnem zabita členem Luciánské aliance Simeonem.

Lidé z velitelství Hvězdné brány v čele s Richardem Woolseym se pokouší přesvědčit spojence na planetě bohaté na naquadrii, aby svolili k pokusu otevřít červí díru na Destiny. Mají ale podezření, že je planeta infiltrována Aliancí. Mezitím řeší Dr. Rush dilema, spočívající v nemožnosti fyzického kontaktu s doktorkou Perryovou, jejíž vědomí je nahrané v systémech lodi.

Během průzkumu planety se tým ocitá pod útokem a desátník Reynolds a TJ jsou zajati mimozemským tvorem. Varr a zbytek lidí z Luciánské aliance nabídnou pomoc při stopování tohoto cizího tvora. Mezitím Eli a pan Brody už mají dost toho, jak o všem rozhoduje Rush, a tak se rozhodnou ho neuposlechnout. Přes jeho zákaz začnou prozkoumávat místnost se stázovými komorami, což se neobejde bez následků...

Destiny je opět pod palbou dronů. Nikdo netuší, jak je jejich mateřská loď mohla tak rychle lokalizovat. Po každém takovém útoku je loď slabší a slabší. Proto je vyslán jeden tým na planetu, kde by mohli najít potřebné vybavení. K překvapení všech potkávají lidskou rasu. Jejich zástupci tvrdí, že jsou potomky expedice, která byla díky červí díře poslána o 2000 let zpátky v čase na jinou planetu. Když je Destiny napadena, rozhodnou se je vzít s sebou na palubu.

Z Destiny je vyslán raketoplán se skupinou, která má za úkol zjistit, co se stalo na planetě Novus. Při hledání najdou prastarou knihovnu ve starodávných rozvalinách. Knihovna popisuje celou historii kolonistů od doby, kdy tam přišli. Ale pomalu zjišťují, že něco na jejich příběhu nesedí. S výzkumem si budou muset pospíšit, neboť planetu sužují zemětřesení, což jen zvyšuje její nestabilitu, která by mohla způsobit zničení celé planety.

Destiny potřebuje akutně doplnit palivové články. Ale při každém výstupu z hyperprostoru na ně čekají droni. Pořád není zcela jasné, jak zjišťují jejich polohu. Nicméně má posádka ještě jeden pokus, než dojde energie úplně. Eli navrhuje plán, který zahrnuje průlet modrým obrem. Plukovník Young souhlasí, ale nechá většinu posádky evakuovat na blízkou planetu. Vybraná skupina složená z doktora Rushe, Elie a Lisy Parkové se pokusí proletět hvězdou ve snaze doplnit energii a zbavit se nepřátel.

Eli a doktor Rush přichází na způsob, jak lokalizovat mateřskou loď dronů za pomocí dálkových senzorů Destiny. Jediný problém je v tom, že drony na ně čekají na každé možné zastávce, kterou na své cestě udělají. Zároveň si uvědomují, že s ní nemohou bojovat pokaždé, když vystoupí z hyperprostoru. Eli navrhuje možnost letět do vzdálené galaxie, přičemž by drtivá většina posádky byla uložena stázových komor, které se na Destiny nacházejí.